自查1：工資個稅計算是否正確
重點檢查工資表中代扣的個稅金額是否依法按照稅法規(guī)定計算，是否存在人為計算錯誤、故意少交個稅的情況。
自查2：人員是否真實
重點檢查工資表上的員工是否屬于公司真實的人員，是否存在虛列名冊、假發(fā)工資現(xiàn)象。
自查3：工資是否合理
《實施條例》第三十四條所稱的“合理工資薪金”，是指企業(yè)按照股東大會、董事會、薪酬委員會或相關管理機構(gòu)制訂的工資薪金制度規(guī)定實際發(fā)放給員工的工資薪金。稅務機關在對工資薪金進行合理性確認時，可按以下原則掌握：
（一）企業(yè)制訂了較為規(guī)范的員工工資薪金制度；
（二）企業(yè)所制訂的工資薪金制度符合行業(yè)及地區(qū)水平；
（三）企業(yè)在一定時期所發(fā)放的工資薪金是相對固定的，工資薪金的調(diào)整是有序進行的；
（四）企業(yè)對實際發(fā)放的工資薪金，已依法履行了代扣代繳個人所得稅義務。
（五）有關工資薪金的安排，不以減少或逃避稅款為目的；
自查4：是否申報了個稅
重點檢查企業(yè)工資表上的人員是否均在金稅三期個稅申報系統(tǒng)中依法申報了“工資薪金”項目的個人所得稅。
自查5：是否存在兩處以上所得
根據(jù)《個人所得稅自行納稅申報辦法》（國稅發(fā)〔2006〕162號）第二條第（二）項規(guī)定：“從中國境內(nèi)兩處或者兩處以上取得工資、薪金所得的，應當按照本辦法的規(guī)定辦理納稅申報?！?
第十一條第（一）項規(guī)定：“從兩處或者兩處以上取得工資、薪金所得的，選擇并固定向其中一處單位所在地主管稅務機關申報?！?
個人取得兩處及以上工資、薪金所得，應固定一處單位，攜帶個人身份證及復印件、發(fā)放工資、薪金的合同及發(fā)放證明，于每月15日前，自行向固定好的單位所在地稅務機關合并申報個人所得稅，多退少補。
自查6：是否存在已經(jīng)離職人員未刪除信息
重點檢查企業(yè)工資表中是否還存在人員已經(jīng)離職、甚至已經(jīng)死亡等，但是仍然申報個稅，未及時刪除這些人員的信息的現(xiàn)象。
自查7：適用稅目是否正確
重點檢查企業(yè)是否存在在計算個稅的時候是否故意把“工資薪金”項目轉(zhuǎn)換為“偶然所得”“其他所得”等，把高稅率項目轉(zhuǎn)為低稅率項目，造成少申報個稅。
自查8：年終獎計稅方法是否正確
對于雇員當月取得的全年一次性獎金，采取除以12個月，按其商數(shù)確定適用稅率和速算扣除數(shù)的計稅辦法。
注意：在一個納稅年度內(nèi)，對每一個納稅人，該計稅辦法只允許采用一次。
自查9：免稅所得是否合法
重點檢查工資表中的免征個稅的所得項目是否符合稅法規(guī)定，如免征個稅的健康商業(yè)保險是否符合條件、通訊補貼免征個稅是否符合標準等。
